在荧光显微镜中，样品在被特定波长的光激活时发射能量。一些物质，如叶绿素和一些矿物质会自然地做到这一点，而其他物质则需要其他化学触发剂的帮助。

  荧光显微镜通常由以下组件组成：

  - 光源，可以是氙气或汞灯、LED或激光器。
  - 激发滤波器，其仅从光源中选择能够激发样本的激发波长。
  - 二向色分束器或反射镜，它以波长的函数来传输和反射光。
  - 发射滤波器，它通过选择不同波长的光来确保只传输从样品中发出的光。
  - CCD相机，它是广泛用于探测发射光的设备，通常与显示生成图像的计算机屏幕相连接

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